近日，四川大学华西医院国家杰出青年基金获得者、生物治疗国家重点实验室杨胜勇教授课题组在美国化学学会创办的国际权威综述学术期刊Chemical Reviews杂志（IF:54.301）发表了题为“Concepts of Artificial Intelligence for Computer-Assisted Drug Discovery”的论文。
课题组杨欣博士为论文第一作者，杨胜勇教授为通讯作者，另一通讯作者为瑞士苏黎世联邦理工学院Gisbert Schneider教授，四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室为文章第一作者单位。该文章得到国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金青年项目、国家科技重大专项、华西医院1·3·5工程、国家博士后创新人才计划等项目的支持。
近年来，以深度学习（deep learning）为代表的人工智能（artificial intelligence, AI）技术获得快速的发展，被认为是新一轮科技革命和产业变革的重要驱动力量，同时也为加快创新药物研发带来了新的希望，推动药物研发从传统的以靶点和结构信息为核心，逐渐转变为以数据和算法为核心的模式。目前，深度学习已成功地应用于图形图像识别、自动驾驶、人类智力游戏等领域，并获得了巨大的成功。虽然如此，由于创新药物研发本身的一些特殊性，导致深度学习在创新药物研发中的应用需解决许多关键科学问题，比如如何发展更适用于分子二维及三维结构信息特征的表征方式。
该论文全面综述了人工智能算法及其在药物化学中的应用。在介绍了算法的基本原理后，文章分别探讨了人工智能算法在基于结构和配体的虚拟筛选、从头药物设计、物化和药代动力学性质预测、老药新用及相关领域的应用。最后，论文总结了当前方法的一些挑战和局限性，以期为AI辅助的药物发现和设计指出未来潜在的发展方向。
杨胜勇教授团队一直致力于计算机辅助药物分子设计方法与应用，以及针对重大疾病的小分子靶向药物研究，取得了丰硕的成果：已在本领域顶级期刊或重要期刊发表SCI论文260多篇，申请专利70余项，获授权专利30余项（包括12项国际专利），研发的6个候选新药已转让到国内大型制药公司，其中两个已进入临床试验。此外，杨胜勇教授担任Signal Transduction and Targeted Therapy期刊常务副主编及多个国际期刊的编委，以第一完成人获国家自然科学二等奖（2018）、教育部自然科学一等奖（2015）、药明康德生命化学研究学者奖（2012）等。
文章链接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.chemrev.8b00728
