四川大学华西医院小儿外科成立于1960年10月，由胡廷泽教授创建，是国内最早建立的小儿外科中心之一，也是全国最早批准的六个硕士、博士点之一。拥有教授10名、副教授12名，培养博士、硕士研究生近百名。
小儿外科2006年成为首批卫生部全国小儿外科专科医师培养基地，2007年被授予儿科学卫生部全国重点学科，2012年成立四川大学华西儿童医学中心；2018年成为国家先天性结构畸形基金定点单位，2019年成为西部儿科医护人员进修培训基地。2019年在华西第二医院锦江院区开设病房，2020年创建国家儿童区域医疗中心（西南区域）。2021年获《全国青年文明号》，获批国家临床重点专科单位。
经过60多年发展，已成为西部区域重要的小儿外科疑难重症诊疗中心，卫生部全国重点学科单位，国家临床重点专科单位，中华医学会小儿外科专委会副主任委员单位，四川省和成都市医学会小儿外科专委会主委单位，综合实力和学术影响力位于全国前列。同时将“学科交叉”和“转化医学”作为重要方向，与国外院校开展交流合作，促进临床科研水平提升。
目前编制床位167张，病房位于锦江院区9楼B区（小儿骨科）、8楼B区（小儿普外/普胸）、8楼A区（小儿ICU等），年门诊量突破10万人次，年全麻手术10000台次。开展儿童肝移植、肾移植、脊柱侧弯、肺气道畸形、泌尿生殖器畸形、骨关节畸形、儿童实体肿瘤、微创达芬奇机器人手术。
四川大学华西天府医院小儿外科编制床位30张，病房位于住院部2楼B区，开展普外、骨科、泌尿专业，与本部实行一体化管理。
